Dit maakt weliswaar een uiterst flexibel gebruik van de verschillende soorten comités mogelijk, maar deze flexibiliteit heeft ook veelvuldig geleid tot onenigheid tussen Raad en Europees Parlement in medebeslissingskwesties.
Si ceci permet une utilisation très souple des types de comité, cette même flexibilité est à l'origine de nombreux désaccords entre le Conseil et le Parlement européen dans les questions de codécision.