Het Agentschap zal worden bestuurd door een Raad van Bestuur die uit 16 leden bestaat en taalkundig paritair is samengesteld. Onder de leden zijn er twee vertegenwoordigers van elke entiteit die het akkoord gesloten heeft en twee vertegenwoordigers van de economische actoren van elke entiteit.
L'Agence sera dirigée par un Conseil d'administration composé de 16 membres, selon la parité linguistique, dont deux représentants de chaque entité partie à l'accord et deux représentants des acteurs économiques de chaque entité.