Atovaquon is sterk aan plasma-eiwitten gebonden (> 99 %), maar verdringt andere sterk eiwitgebonden geneesmiddelen in vitro niet, hetgeen erop duidt dat het optreden van geneesmiddelinteracties ten gevolge van verdringing onwaarschijnlijk zijn.
L'atovaquone est fortement liée aux protéines plasmatiques (> 99 %) sans qu’une interaction avec d’autres produits à forte liaison protéique n’ait été observée in vitro : la probabilité de survenue d'une interaction médicamenteuse liée à ce mécanisme est donc faible.