Bij ongeïnfecteerde volwassen en pasgeboren ratten, was de concentratie anidulafungin in de hersenen na een enkele dosis laag (hersenen-plasmaverhouding ongeveer 0,2), hoewel de concentraties in de hersenen van ongeïnfecteerde pasgeboren ratten na vijf dagelijkse doseringen toenamen (hersenenplasmaverhouding ongeveer 0,7).
La concentration d’anidulafungine dans le cerveau était faible chez les rats adultes et les rats nouveaunés non infectés après administration d’une dose unique (le ratio concentration cerveau/plasma est d'environ 0,2). Cependant, les concentrations dans le cerveau ont augmenté chez les rats nouveau-nés non infectés après administration quotidienne d'une dose pendant cinq jours (le ratio concentration cerveau/plasma est d'environ 0,7).