Na lange onderhandelingen stemde de delegatie van het Parlement aarzelend ermee in dat de raad van bestuur zou worden samengesteld uit een vertegenwoordiger van elke lidstaat, behalve de vier vertegenwoordigers van de Commissie en zes vertegenwoordigers (zonder stemrecht) van de aandeelhouders van de sector, met inbegrip van de industrie en de sociale partners.
Au terme de longues négociations, la délégation du Parlement a accepté, sans enthousiasme, que le conseil d'administration de l'Agence soit composé d'un représentant de chaque État membre en plus des quatre représentants de la Commission et des six représentants (ne disposant pas du droit de vote) des acteurs du secteur, en ce compris l'industrie ferroviaire et les partenaires sociaux.