Tot de bepalingen van het Ballastwaterverdrag die onder de federale bevoegdheid vallen, behoren onder andere de bepalingen inzake de schouwing en certificering van schepen die de Belgische vlag voeren, de goedkeuring van de ballastwaterbeheersystemen en de inspectie van schepen onder vreemde vlag die in Belgische havens of los- en laadplaatsen buitengaats zijn.
Parmi les compétences de la Convention des eaux de ballast qui relèvent de la compétence fédérale, il y a entre autres celles relatives à la visite et certification des navires battant le pavillon belge, l'approbation des systèmes de gestion des eaux de ballast et l'inspection des navires battant un pavillon étranger qui se trouvent dans les ports belges ou terminaux au large.