De structuur van het EIT omvat twee niveaus: een raad van bestuur met een kleine ondersteunende administratie (de kern van het EIT) en een aantal kennisgemeenschappen in heel Europa die op strategische interdisciplinaire gebieden actief zijn.
La structure de l’IET reposera sur deux piliers : un comité directeur entouré d’une équipe administrative restreinte constituera son noyau central et un ensemble de communautés de la connaissance réparties partout en Europe organiseront celles de ses activités qui porteront sur des matières stratégiques interdisciplinaires.