Ernstige bijwerkingen als gevolg van ivacaftor hebben zich soms voorgedaan (minder dan 1 op de 100 mensen) en zijn onder andere maagpijn (buikpijn).
Les effets indésirables graves provoqués par l’ivacaftor étaient peu fréquents (moins d’une personne sur 100) et comprenaient une douleur abdominale (au niveau de l’estomac).