De Hoge Gezondheidsraad werkt regelmatig samen met andere instellingen zoals bijvoorbeeld het Wetenschappelijk Comité van het Federaal Agentschap voor de Veiligheid van de Voedselketen (FAVV).
Le Conseil Supérieur de la Santé collabore régulièrement avec d’autres institutions comme par exemple le Comité Scientifique de l’Agence Fédérale pour la Sécurité de la Chaîne Alimentaire (AFSCA).