De meest frequent gerapporteerde bijwerkingen tijdens de gecontroleerde klinische studies met rabeprazol waren hoofdpijn, diarree, buikpijn, asthenie, flatulentie, huiduitslag en droge mond.
Les évènements indésirables les plus souvent rapportés au cours d'études cliniques avec du rabéprazole ont été : céphalées, diarrhées, douleur abdominale, asthénie, flatulence, rash et sécheresse buccale.