Aangezien Saccharomyces boulardii een gist is en derhalve gevoelig voor antimycotica, mag het niet samen worden gebruikt met die geneesmiddelen. Het zou kunnen dat Saccharomyces boulardii fout positieve uitkomsten geeft bij microbiologisch onderzoek van de stoelgang.
Du fait de sa nature fongique, Saccharomyces boulardii est sensible aux antifongiques, il ne peut donc être utilisé avec ces médicaments.
