La participation des acteurs locaux à la gestion du réseau Natura 2000 est également essentielle et offre de nouvelles possibilités en termes de gestion durable de l'affectation des sols, comme l'ont démontré des initiatives telles que l'élevage respectueux de la conservation mis en place par le biais d’un projet LIFE dans le paysage karstique de Burren, en Irlande.
Het is bovendien van cruciaal belang om plaatselijke belanghebbenden te betrekken bij het beheer van Natura 2000. Dit schept nieuwe mogelijkheden voor duurzaam beheer inzake landgebruik, zoals werd aangetoond door initiatieven als op instandhouding gerichte landbouw (bv. het LIFE-project in het vergletsjerde karstgebied in Burren, Ierland).