Vertaling van "était en bonne santé et avait fondamentalement évolué depuis " (Frans → Engels) :

À la suite de la publication, certaines parties ont contesté la conclusion selon laquelle l'industrie de l'Union était encore fragile, en déclarant qu'elle était en bonne santé et avait fondamentalement évolué depuis 1999.
Following the disclosure some parties contested the conclusion that the Union industry was still fragile claiming that the Union industry was in a healthy state and has substantially transformed since 1999.

En ce qui concerne l'audit, je dirais, de manière générale — et il me faut rappeler que depuis nos vérifications, la situation a évolué — que le ministère avait mis en place un système conforme aux normes internationales, et c'était une bonne chose.
In general, I would characterize the audit—and remember that this is at the point in time that we did the audit and reported on it, and things have happened since— by noting that the department had put in place a system that was consistent with international standards, and that was a good thing.