Autre aspect du fondement législatif du ministère, la Loi sur la protection des eaux navigables est également un élément déclencheur de la Loi canadienne sur l'évaluation environnementale, et une proposition en vue d'introduire un nouveau site d'aquaculture peut faire en sorte qu'on exige une évaluation environnementale aux termes de la Loi sur la protection des eaux navigables.
On another side of the legislative basis of the department, the Navigable Waters Protection Act is also a trigger for the Canadian Environmental Assessment Act, and a proposal to introduce a new aquaculture site may give rise to a requirement for an environmental assessment under the NWPA as well.