En tant que mesure d'exécution du programme "Horizon 2020", l'entreprise commune Bio-industries doit évidemment s'inscrire dans le droit fil des priorités d'"Horizon 2020" en matière de recherche et d'innovation, tels qu'établis dans les volets "Primauté dans le domaine des technologies génériques et industrielles" et "Sécurité alimentaire, agriculture et sylviculture durables, recherche marine, maritime et dans le domaine des eaux intérieures et bioéconomie".
BBI as implementing measure of Horizon 2020 has obviously to be in line with the Horizon 2020 research and innovation priorities as established in the parts Leadership in enabling and industrial technologies and in the Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research and the bioeconomy challenge.