D'autre part, les opposants à toute mention des logiciels dans le droit des brevets craignent que les brevets de logiciels ne deviennent la règle générale, ce qui créerait une incertitude juridique permanente quant à l'utilisation des algorithmes et des solutions techniques qui circulent librement pour l'instant ou entraînerait des blocages limitant l'innovation.
On the other hand, the opponents of any mention of software in patent law fear that software patents may become the general rule, thus creating permanent legal uncertainty about the use of algorithms and technical solutions that currently circulate freely or the creation of bottlenecks limiting innovation.