Les coûts de développement et de gestion du système devraient être élevés, aussi bien pour la Commission que pour les États membres. Mais la charge budgétaire, à la fois pour la Commission et les États membres, ne représenterait que 5 % du montant total des revenus éludés pour une année donnée. Les pertes de revenus dues à la fraude notamment en matière de tabacs et d'alcools ont été estimées à €4,8 milliards pour la seule année 1996.
Even so, the cost to their respective budgets will probably amount to no more than 5% of the revenue lost to tax evasion in a given year; in 1996 alone tobacco and alcohol fraud was responsible for an estimated €4.8 billion in lost revenue.