Das Zentrum hätte die Aufgabe, die Überwachung und Erkennung zu verstärken, gemeinsame Reaktionen zu koordinieren, die wissenschaftliche Beratung und die Kommunikation mit der Öffentlichkeit zu verbessern, die gemeinsame Forschungskapazität zu vergrößern, ein Netz von Referenzlaboratorien zu errichten und aufrecht zu erhalten und mit den Mitgliedstaaten, den Beitrittsstaaten und internationalen Organisationen wie der Weltgesundheitsorganisation (WHO) zusammenzuarbeiten.
Doel hiervan zou zijn verbetering van toezicht en opsporing, coördinatie van gemeenschappelijke bestrijdingsmaatregelen, verbetering van het wetenschappelijk advies en de communicatie met het publiek, vergroting van de gemeenschappelijke onderzoekscapaciteit, instelling en instandhouding van een netwerk van referentielaboratoria en samenwerking tussen de lidstaten, de toetredende staten en internationale organisaties zoals de Wereldgezondheidsorganisatie (WGO).
