Darüber hinaus ist die Erhaltung in den Genbanken mit einer Reihe von Parametern konfrontiert, die die Effizienz der ex situ-Erhaltung gefährden: Wahl der Methoden zur Sammlung der Muster, Auswahl der zu sammelnden genetischen Ressourcen, Auswahl des anzuschaffenden Vermehrungsguts und Grenzen der Regenerationsarbeiten, zahlreiche Methoden zur Verwaltung der Datenbanken und Problem der Dubletten sowie Mangel an Verwaltungspersonal und unzureichende Finanzmittel für die Erhaltungsarbeiten.
Bovendien zijn er bij de instandhouding in genenbanken bepaalde parameters in het spel die de doeltreffendheid van de instandhouding ex situ kunnen schaden: keuze van de methodes voor het verzamelen van monsters, keuze van de te verzamelen genetische hulpbronnen, keuze van de te vermeerderen aanwinsten en grenzen van de regeneratieactiviteiten, het grote aantal methodes voor het beheer van databanken en het probleem van dubbel werk, gebrek aan beheerspersoneel en te geringe middelen voor instandhoudingswerkzaamheden.
