Eine neue Regelung, die dem erweiterten Aufgabenbereich der JAA Rechnung trug, wurde 1990 in Kraft gesetzt, und der formelle Status der JAA beruht auf diesen Vereinbarungen von 1990, unterzeichnet von den für Zivilluftverkehr zuständigen Generaldirektoren der beteiligten Staaten als einem der Europäischen Zivilluftfahrtkonferenz (ECAC) angegliederten Gremium, das seinerseits auf Initiative des Europarates mit Unterstützung der ICAO geschaffen wurde.
In 1990 trad een nieuwe regeling in werking die de versterkte rol van de JAA weerspiegelt, en kreeg de JAA een officiële status krachtens de regelingen van 1990, die door de directeuren-generaal burgerluchtvaart van de deelnemende landen zijn ondertekend, als geassocieerd lichaam van de Europese burgerluchtvaartconferentie (ECAC), die op initiatief van de Raad van Europa met steun van de ICAO is opgericht.