Um einige der mit dieser Einbeziehung verbundenen Probleme zu veranschaulichen, sei darauf hingewiesen, dass die auf nationaler Ebene durchgeführten Prüfungsarbeiten, die sich nur auf Systeme und nicht auf die zugrunde liegenden Vorgänge beziehen, vom Europäischen Rechnungshof noch nicht verwendet werden können, um „.dem Europäischen Parlament und dem Rat eine Erklärung über die Zuverlässigkeit der Rechnungsführung sowie die Rechtmäßigkeit und Ordnungsmäßigkeit der zugrunde liegenden Vorgänge „(Artikel 248 Absatz 1 des EG-Vertrags) vorzulegen.
Ter verduidelijking dat bepaalde problemen inherent zijn aan deze integratie, dient te worden benadrukt dat nationale controles die enkel betrekking hebben op de systemen zonder dat de onderliggende transacties zijn gecontroleerd, vooralsnog niet door de Europese Rekenkamer kunnen worden gebruikt teneinde". aan het Europees Parlement en de Raad een verklaring voor te leggen waarin de betrouwbaarheid van de rekeningen en de regelmatigheid en de wettigheid van de onderliggende verrichtingen worden bevestigd" (artikel 248 (lid 1) van het EG-Verdrag).
