Der potentielle Interessenkonflikt zwischen Innenrevision und Finanzkontrolle - diese Aufgaben sind derzeit in einer einzigen Generaldirektion (Generaldirektion Finanzkontrolle) vereint - soll durch die Einrichtung eines unabhängigen Dienstes für interne Finanzprüfung gelöst werden, der dem für die Reform zuständigen Vizepräsidenten unmittelbar unterstellt sein wird.
Voorts komt er een oplossing voor het probleem van het mogelijke belangenconflict tussen interne audit en financiële controle - taken die momenteel binnen één enkel directoraat-generaal (DG Financiële controle) worden uitgevoerd: er wordt een onafhankelijke Dienst voor Interne Audit opgericht die rechtstreeks ressorteert onder de Vice-Voorzitter voor Hervorming.