Das SIS II besteht aus einer zentralen Datenbank, dem so genannten „zentralen Schengener Informationssystem“ (CS-SIS), für dessen Betriebsmanagement die Kommission sorgt und das mit den von jedem Mitgliedstaat festgelegten nationalen Zugangsstellen (NI-SIS) verbunden ist.
SIS II bestaat uit een centrale gegevensbank, „het centrale Schengeninformatiesysteem” (CS-SIS), waarbij de Commissie zal zorgen voor het operationele beheer in verband met de door elke lidstaat vastgestelde nationale toegangspunten (N-SIS).