Was im Einzelnen die Zusammenarbeit zwischen dem Rechnungshof und den einzelstaatlichen Rechnungskontrollorganen angeht, so besagt Artikel 287 Absatz 3 AEUV, dass in dem Fall, dass die Prüfung in den Mitgliedstaaten durchgeführt wird, der Rechnungshof und die einzelstaatlichen Rechnungsprüfungsorgane „unter Wahrung ihrer Unabhängigkeit vertrauensvoll“ zusammenarbeiten sollen.
Wat de specifieke samenwerking tussen de Rekenkamer en de nationale controle-instanties betreft, bepaalt artikel 287, lid 3 VWEU dat wanneer er controle dient te geschieden in de lidstaten, de Rekenkamer en de nationale controle-instanties samenwerken "in onderling vertrouwen en met behoud van hun onafhankelijkheid".