Mit dem Protokoll soll eine Grundlage für den grenzüberschreitenden Verkehr mit LVO, die aus der modernen Biotechnologie stammen, geschaffen werden, weshalb im Mittelpunkt die Einigung auf ein Verfahren mit vorheriger Information und Zustimmung steht.
Er werd overeengekomen dat het protocol een kader dient te bieden voor het internationale grensoverschrijdende verkeer van door moderne biotechnieken verkregen LGO's, en dat derhalve de vaststelling van een procedure inzake voorafgaande geïnformeerde toestemming de kern van het protocol diende te vormen.