In der Analyse wird jedoch auch angemerkt, dass einige Faktoren mit dem Schwerpunkt auf strukturellen Merkmalen, beispielsweise das allgemein niedrige Niveau der Meistbegünstigungszollsätze und die Handelsstruktur der LDC-Länder, die Wirksamkeit des APS zum Teil beschränken.
Uit de analyse blijkt echter ook dat er factoren zijn die de effectiviteit van de GSP-regeling in bepaalde mate beperken. Die factoren houden meestal verband met een aantal structurele kenmerken, zoals het in het algemeen lage niveau van de EU-tarieven voor meest begunstigde naties en de structuur van de handel van de minst ontwikkelde landen.