Die Richtlinie verfolgt im wesentlichen zwei Ziele: zum Einen sollen dadurch die nationalen Rechtsvorschriften für Nahrungsergänzungen harmonisiert werden, um die erheblichen Probleme beim freien Warenverkehr von Nahrungsergänzungen zu verringern bzw. zu beheben. Zum Anderen soll ein angemessenes Maß an Verbraucherschutz in allen Mitgliedstaaten der Europäischen Union bei der Anwendung von Nahrungsergänzungen etabliert werden.
Met de richtlijn wordt hoofdzakelijk tweeërlei nagestreefd: enerzijds harmonisatie van de nationale wetgevingen inzake voedingssupplementen teneinde de aanzienlijke problemen bij het vrije verkeer van voedingssupplementen te verminderen dan wel uit de weg te ruimen; anderzijds een adequate consumentenbescherming in alle lidstaten van de Europese Unie bij de toepassing van voedingssupplementen.