Kommt es trotz Antibiotikabehandlung zu Bakterienkontamination, so ist der Überstand vor dem Anlegen einer Subkultur bei 2 000 bis 4 000 × g und 2-5 °C 15-30 Minuten zu zentrifugieren und/oder durch ein 0,45-μm-Filter (Membran mit geringer Proteinbindung) zu filtrieren.
Als er ondanks behandeling met antibiotica sprake is van een bacteriële verontreiniging, wordt het supernatans vóór de doorkweek gedurende 15 tot 30 minuten bij een temperatuur van 2 tot 5 °C gecentrifugeerd bij 2 000 tot 4 000 × g, en/of gefiltreerd met een filter van 0,45 μm (membraanfilter met een geringe eiwitbinding).