Die Kommission wird vom "Mautausschuss" unterstützt, der sich aus den Vertretern der Mitgliedstaaten und für den Schutz persönlicher Daten sowie Sicherheits- und Umweltthemen zuständigen NRO zusammensetzt und in dem der Vertreter der Kommission den Vorsitz führt.
De Commissie wordt bijgestaan door het "Comité elektronische tolheffing", dat bestaat uit vertegenwoordigers van de lidstaten en van NGO's die verantwoordelijk zijn voor bescherming van de privacy, veiligheids- en milieukwesties, en wordt voorgezeten door de vertegenwoordiger van de Commissie.