Im Rahmen des Entlastungsverfahrens 2006 versah der Europäische Rechnungshof (ERH) seine Zuverlässigkeitserklärung in Bezug auf die Rechtmäßigkeit und Ordnungsmäßigkeit der zugrunde liegenden Vorgänge der EPA mit einer Einschränkung, die auf der Bemerkung basierte, dass die Auftragsvergabeverfahren nicht im Einklang mit den Vorschriften der Finanzregelung standen.
In de kwijtingsprocedure 2006 heeft de Europese Rekenkamer opmerkingen geplaatst bij de wettigheid en regelmatigheid van de onderliggende verrichtingen van de EPA op grond van de vaststelling dat het aanbestedingssysteem niet in overeenstemming was met de voorschriften van het Financieel Reglement.