Die EACEA ist für die Verwaltung bestimmter Aspekte der folgenden EU-Programme sowie, für eine Übergangszeit, die Durchführung der verbleibenden Maßnahmen ihrer Vorläuferprogramme aus der Zeit von 2007 bis 2013 zuständig:
Het agentschap is belast met de uitvoering van bepaalde delen van de volgende EU-programma's, en gedurende een overgangsperiode ook met de uitvoering van de erfenis van voorgaande programma's uit de periode tussen 2007 en 2013: