SESAR umfasst drei Phasen: die "Definitionsphase" (2005-2008), in der der SESAR-Masterplan zur Verwirklichung des künftigen Flugverkehrsmanagementsystems festgelegt wurde, die "Entwicklungsphase" (2008-2013), die von dem gemeinsamen Unternehmen überwacht werden soll, und die "Errichtungsphase" (2014-2020).
Het bestaat uit drie fasen: de definitiefase (2005-2008), tijdens welke het SESAR-masterplan voor de totstandbrenging van het toekomstige verkeersleidingssysteem is opgesteld, de ontwikkelingsfase (2008-2013), waarop toezicht zal worden gehouden door de gemeenschappelijke onderneming, en de ontplooiingsfase (2014-2020).