Es gibt eigene Leitlinien, in denen die Verfahren für die Verwaltung der EGF-Mittel beschrieben sind sowie die Rolle der verschiedenen beteiligten Stellen und die Mechanismen, mit denen gewährleistet werden soll, dass die allgemeinen Grundsätze für die Verwaltung der EGF-Mittel und der einschlägige Rechtsrahmen beachtet werden.
Specifieke richtsnoeren beschrijven de EFG-beheersprocedures, de rol van de verschillende betrokken organen en de mechanismen die de naleving van de algemene beginselen van het EFG-beheer en het desbetreffende rechtskader waarborgen.